In Baden-Württemberg gibt es zehn Häfen und zahlreiche Lade- und Löschplätze, an denen im Jahr 2010 insgesamt rund 30,6 Millionen Tonnen Güter umgeschlagen wurden. Die Häfen Mannheim, Karlsruhe, Kehl, Breisach, Weil am Rhein, Heilbronn, Stuttgart, Plochingen sowie Wertheim sind Mitglieder der Arbeitsgemeinschaft öffentlicher Binnenhäfen Baden-Württemberg, einer Untergliederung des Bundesverbands öffentlicher Binnenhäfen e. V. (BÖB). Der Hafen Rheinfelden ist nicht Mitglied.
In Baden-Württemberg wird nach Nordrhein-Westfalen bundesweit der zweitgrößte Güterumschlag in der Binnenschifffahrt erzielt. Im Jahr 2009 verzeichneten alle baden-württembergischen Häfen - aber auch nahezu alle Häfen Deutschlands - starke Einbußen beim Umschlagsvolumen. Im Jahr 2010 ist eine deutliche Erholung der Weltwirtschaft eingetreten, was zu einem deutlichen Wiederanstieg der Binnenschifftransporte geführt hat. Im Jahr 2017 wurden in baden-württembergischen Häfen sowie an Lösch- und Ladeplätzen insgesamt 32,1 Millionen Tonnen Güter im Binnenschiffsverkehr umgeschlagen. Nach Angaben des Statistischen Landesamtes entspricht dies einem Plus von 6,3 Prozent oder 1,9 Millionen Tonnen gegenüber 2016.
